胃酸最常造成的疾病是逆流至食道而造成食道發炎，大部分的人都曾有過胃酸引起的心口灼熱與胸悶，程度因人而異，有時會引起慢性咳嗽或氣喘。食道的複層鱗狀上皮(Stratified squamous epithelium) 抗酸性遠不及胃黏膜上皮，若長期受到胃酸侵蝕，首當其衝的是食道與胃交界的賁門 (Cardia)。
賁門的上方是食道的鱗狀上皮 (squamous epithelium, 上圖右側)，下方是胃的柱狀上皮 (columnar epithelium, 上圖左側)。鱗狀上皮若短期受損，會自行修復，若長期被胃酸侵蝕，胃的幹細胞 (Gastric stem cells) 會移動至賁門的鱗狀上皮部位，參與修補鱗狀上皮的缺損，久而久之，部分鱗狀上皮會被胃的柱狀上皮取代。由於賁門的食道部分長期因胃酸侵蝕受傷，細胞必須不斷分裂去彌補缺口；任何細胞只要有異於常態的快速分裂，DNA就可能發生突變 (p53仍是最重要的突變)。因此，賁門的食道上皮長期受傷，修補後被胃上皮取代的細胞，也會因DNA突變而發生 "分化的錯誤"，產生小腸上皮的 Goblet cells; 此種上皮之轉變稱為 Barrett’s metaplasia，大約100-200個這樣的病變之中，會有一個發展為賁門的癌症。
胃鏡下正常之賁門，中間鋸齒狀的一圈 "較鮮的紅色區" 是胃黏膜，外圍顏色較白的粉紅區為食道黏膜。
食道黏膜長期受胃酸侵蝕，因破損修補的作用，胃黏膜上移取代食道黏膜。箭頭是食道的破損處。
Barrett’s esophagus 之切片，做胃鏡時，夾取被胃黏膜取代之組織。
1. 病理組織出現類似腸道絨毛的上皮，並有Goblet cells (黑色箭頭)。
2. 細胞長期受損而快速分裂，部分區域的上皮細胞排列參差不齊，有些看起來像 Low grade dysplasia (淺綠箭頭)，有些看起來像 high grade dysplasia (深綠箭頭)。
3. 淋巴細胞瀰漫於腺體間隙，顯示慢性發炎。
Dyslpasia 之程度判定不易，低倍鏡下：
Low grade dysplasia：細胞核染色深，細胞排列參差不齊，Basement membrane 底線整齊。
High grade dysplasia：細胞核染色深，細胞排列參差不齊 (常大於3層排列)，Basement membrane 底線因細胞快速分裂顯得有點凌亂。
高倍鏡下
Dysplasia 細胞之特徵：細胞核染色深，仔細看，核仁常有兩三個，代表細胞分裂旺盛。
Biopsy pathology of Barrett's esophagus
左(A) Ano dysplasia
中(B) low grade dysplasia
右(C) high grade dysplasia
High grade dysphasia 要密切追蹤，癌症發生率極高。
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