人生沒有用不到的經歷

昨天又有一例本土確診，是與染疫醫師在病房接觸過的護理師，整理一下四名相關確診。
重症病患(案812)---1/1確診
染疫的醫師(案838)---1/11確診
染疫的醫師女友護理師(案839)---1/11確診
與染疫醫師在病房接觸過的護理師(案852)---1/16確診

案812為本國籍60多歲男性，去年10月至美國探親，12月27日返國，持有登機前3日內檢驗陰性報告，入境後至住處居家檢疫；12月29日至31日陸續出現全身痠痛、發燒及咳嗽症狀，1月1日由衛生單位安排就醫採檢確診。

昨天陳時中公布案812與案838的病毒基因比對結果，用了一句「基因序列幾近相同」，就說「案838非常大非常大可能是從照顧812傳染」是「病毒學」及「分子生物學」外行人說的話。

對新冠病毒基因三萬個鹼基而言，案812與案838採樣定序「幾近相同」代表兩者來自不同的病毒株(儘管只有兩三個鹼基完全不同)。案812與案838確診時間相距僅10天，即使病毒鹼基在10天內發生突變，突變株會以Minor(少量)與原株Major(大量)共存。基因定序時，主訊息會測到Major peak。突變初期，Minor peak會在次訊息中出現一個較小的Peak。染疫醫師(案838)的病毒若來自案812病人，病毒基因序列的主訊息(Major peak)會「完全相同」，即使主訊息相似度達99.99%，兩人也是被不同的病毒株感染。

版主認為，案812(病人)與案838(醫師)的病毒基因定序若沒有顯現完全相同的Major peak，那麼染疫醫師的病毒就不是來自他所照顧的病人(案812)。目前顯示兩者病毒基因序列僅「幾近相同」，案838(醫師)的病毒應該就是來自社區。說明如下圖：
 
病毒的氮鹼若從X(鹼基T)突變為Y(鹼基A)，在病人檢體(X-Y)會同時測到紅色的Major peak(T)與綠色的Minor peak(A)。染疫醫師的病毒若來自他所照顧的病人，兩人的病毒做基因定序比對，Major peaks會完全相同，這就是基因的指紋(Finger print)，病毒突變也會留下痕跡，騙不了人的。